La SFMTA planifie, conçoit, construit, exploite, réglemente et entretient l’un des réseaux de transport les plus diversifiés au monde. En plus des quatre modes de transport (transport en commun, marche, vélo et conduite automobile, qui comprennent les véhicules privés, les taxis, l'autopartage, le stationnement sur rue et hors rue et les véhicules commerciaux), l'Agence supervise directement cinq modes de transport en commun (bus, trolleybus , train léger sur rail, tramway historique et téléphérique), en plus de superviser le service de transport adapté, qui dessert les personnes incapables d'utiliser le service de transport en commun à itinéraire fixe.